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수준 고급
분야 생물
제목 단백질 화합물 상호작용 실험
  • 등록자 한국과학기술정보연구원
  • 등록일 Jun 28, 2023
  • 조회수3,774
  • 리뷰수5

콘텐츠 정보

◆ 맛보기 영상

단백질 화합물 상호작용 실험 맛보기 영상

단백질은 우리 몸의 생명 유지에 필요한 필수 영양소입니다. 단백질은 여러 개의 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결되어 있습니다. 단백질은 신체 세포의 구성 성분일 뿐 아니라 효소, 호르몬, 항체의 구성 성분이기도 합니다. 단백질 구조에 이상이 생기면 질병이 발생할 수 있습니다. 이렇게 단백질의 비정상적 변형으로 발생한 질병을 치료하기 위해서는 이 단백질의 기능을 저해하는 화합물 즉, 약물로 치료할 수 있습니다.

 

단백질 화합물 상호작용 실험에서는 10종의 단백질 중 1종을 선택하고, 100종의 화합물 중에서 랜덤하게 제시되는 10종의 화합물 중 1종을 선택하여 단백질과 화합물의 상호작용을 실험합니다. 선택한 단백질과 화합물의 상호작용 실험이 완료되면 에너지값을 확인할 수 있습니다. 선택한 단백질과 가장 낮은 에너지 값을 갖는 화합물을 찾으면 성공입니다. 총 3번 시도할 수 있으며 실패하면 재시도할 수 있습니다.

 

이 실험을 통해 신약 개발 과정 중 약물 후보 물질을 선별하거나 디자인하는 과정을 경험할 수 있습니다. 이 실험에 적용된 기술은 원자 수준에서 약물-표적 상호작용을 연구하기 위해 널리 사용되는 분자 도킹(molecular docking) 기술입니다. 이 기술을 활용하면 실제 실험보다 저렴한 비용으로 약물 후보 물질을 선별하거나 디자인할 수 있습니다.

 

이 실험을 통해 가능한 학습 내용은 아래와 같습니다.

  • 단백질의 역할, 단백질의 구조
  • 단백질 구조 이상에 따른 질병 유발
  • 단백질 기능 저해 화합물(약물) 선별 과정 이해
  • 단백질과 약물 후보 물질의 상호작용 에너지 계산
  • 분자 도킹 기술

 

< 선수 학습용 추천 영상 >

 

22. 단백질 #단백질 #아미노산 #펩타이드결합 #아미노기 #카복실기 #축합중합 #단백질입체구조 #단백질기능 [통합과학]1단원 5차시 생명체의 구성성분-단백질의 펩타이드 결합(peptide bond of protein) 단백질이란 무엇입니까? Molecular docking | Introduction to basic computational chemistry method | drug-target interaction Molecular docking for Beginners | Autodock Full Tutorial | Bioinformatics


평가 및 리뷰

평가 및 리뷰 별점 5.0
★★★★★
★★★★★
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5 도현공듀 2024-04-15 15:33:02

정말 재미잇어요

5 수련 2022-11-28 23:47:43

단백질 구조를 볼 수 있어서 신기해요.

5 키스티 2022-11-17 17:29:15

약 개발하는 원리~ 관심 있었는데 ㅎㅎㅎㅎㅎ

5 게스트 2022-10-12 15:25:15

요즘 핫한 분야를 살짝 엿볼 수 있어서 좋네요.

5 로미 2022-10-07 15:11:21

단백질 구조를 3차원으로 볼 수 있고, 신약 개발 과정을 이해할 수 있어서 좋은 실험이에요^^

댓글 2

코멘터 2022-12-28 15:28:00

흥미롭습니다. 어떤 원리로, 어떻게 정확하게 계산을 진행하는 것인지 궁금합니다.

한국과학기술정보연구원 2023-07-19 14:35:17

@코멘터님 에게 안녕하세요. VlabON관리자입니다. VlabON은 실제 연구자들이 사용하는 에디슨 소프트웨어를 교육용에 맞게 적용하였습니다. 에디슨 플랫폼은 슈퍼컴퓨터를 연동시킨 웹 기반 플랫폼에 계산과학공학 전문분야별 시뮬레이션 SW를 탑재한 교육·연구 서비스입니다. 계산 과학에 기반한 정교한 시뮬레이션을 통해, 실제 실험과 비슷한 3D가상 실험을 수행할 수 있습니다. VlabON에 관심주셔서 감사합니다.

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